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來源: 發布時間:2023-12-15

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    m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾細胞模型或者發組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節,作者研究了FOXM1的鄰近基因,發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。黑龍江科研技術服務構建動物疾病模型在科研中有著普遍的應用。

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    在人類研究中數據表明,常用實驗動物模型按產生原因分為以下5類:自發性動物模型、誘發型動物模型、遺傳工程動物模型、生物醫學動物模型和陰性動物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發性動物模型:是指動物未經任何有意識的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產生的模型。主要包括突變型的遺傳模型和近郊系的模型。2、誘發型動物模型:亦稱實驗性動物模型。是使用物理、化學或生物因素誘導動物產生某些類似人類表現而制備的動物模型。此模型具有制備方法簡單,實驗條件容易控制,重復性好等特點,廣泛應用于藥物篩選、毒理、傳染理機制的研究。3、遺傳工程動物模型:是利用遺傳工程技術對動物基因組進行修飾,用于研究基因功能或機制的動物模型。也稱基因修飾動物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術有目的的干預動物的遺傳組成,導致動物出現新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學研究的和其他目的所用的動物模型。4、生物醫學動物模型:也是指利用健康生物的特定生物學特征,研究人類相似表現得模型。這類動物模型與人類存在一定的差異,研究者應加以比較,從中獲得有關材料。

    轉錄組測序結果及TCGA數據庫分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中,都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中,通過敲除m6A甲基轉移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調控。進一步通過MeRIP-Seq發現相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析,他們發現了區分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達的轉錄調控的復雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩定狀態的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):'(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):'UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。人工模型是指通過人工手段制造的疾病模型。

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    m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。健康的HEK 293T細胞,一般使用復蘇后10代以內的細胞進行慢病毒的生產,要求無菌以及支原體污染;廣西動物科研技術服務實驗

細胞的結構是細胞生物學的重要研究內容之一。北京血液科研技術服務構建

    小鼠尾尖用精擦拭尾巴,引起輕微的血管擴張;用無菌手術刀、刀片或鋒利的剪刀,快速截斷小鼠尾尖1-2毫米。如果需要多次,之后每次需截除2-3毫米;從尾部像尾尖方向按摩,增加血流;用采集血液;結束后,按壓傷口或使用止血劑來止血;每次量大約可達。小鼠眼球取血單手保定好小鼠;必要時剪掉小鼠胡須,防止污染血液;輕壓取血側眼部皮膚,使眼球充血突出;用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘取;同時用左手中指輕按小鼠心臟部位,以加快心臟泵血速度;當血液流盡時,用脫臼法處死小鼠;大鼠眼眶取血先將小鼠進行麻醉,大鼠翻正反射消失時不在繼續麻醉;抗凝處理過的玻璃毛細采樣管,掰成2-3厘米長度;右手食指和拇指輕按眼眶兩側皮膚,使眼球突出,毛細管從內側的眼球與眼瞼的縫隙處進入,輕輕旋轉毛細管,稍微深入眼球后上方,血液流速快的時候4-5滴即可,溫柔的將毛細管取出;用棉簽按壓大鼠眼眶止血,每次可取血50-100微升,將血液放入冰盒中保存。小鼠心臟取血先將小鼠麻醉,稍靠右側平躺在手術板上固定;左側第三四根肋骨間觸摸心臟,跳動明顯,慢慢進針;針有回血停止進針,開始取血;一次可以300到500微升,小鼠存活,放到加熱墊上待小鼠蘇醒后放入籠中。北京血液科研技術服務構建

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