圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點是否準確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標記層析檢測，發現預測的位點準確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較，也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態和酵母減數分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統；并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術，其他部分暫不過多分析了。新的技術能拓展我們的研究內容；對于這一技術。動物模型的表現與人類疾病可能存在差異，因此需要謹慎使用。上海實驗科研技術服務培養

m6A修飾圖譜構建及作用機制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數量及分布，Peak關聯基因的特征，聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節，作者研究了FOXM1的鄰近基因，發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補，且共表達、共定位，進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖，從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化，組蛋白修飾和染色質重構。近。動物科研技術服務培養干貨分享 | 避坑，微生物培養的污染因素及預防方法，少走彎路。

如果實驗平臺的儀器需要提前預約，建議提前規劃好使用的時間。反復總結尋找答案在整個預實驗的過程中可能會出現很多問題。比如造模效果欠佳、灌胃操作不當、腹腔注射操作失誤、使用不當等引起動物死亡。每遇到問題都需要自己想辦法解決，可以從導師、師兄師姐、文獻、貼吧、視頻教程等找到答案。比如筆者曾遇到同樣的給，發現有的大鼠得很深，有的大鼠還活蹦亂跳，在反復嘗試調整濃度，給劑量，更換方式，后來才發現是動物體重秤的準度有問題，導致體重秤得不準。因此，需要自己反復琢磨到底是實驗過程中哪一個環節出現問題，逐一排除。也要求在每一個實驗步驟需要標準化，統一化，盡可能的排除干擾因素，這樣方便在遇到問題快的找到答案。同時，建議每日總結，大到動物死亡原因分析，小到灌胃操作耗時多長時間。建議反復總結出每天實驗的優缺點。做任何一個操作之前，建議提前腦海中反復模擬，準備好相關工具和試劑，避免臨用之際缺少的，影響實驗操作節奏和個人心情。筆者曾經灌胃操作的時候發現竟然忘帶了，只好重新回實驗室準備，那真叫一個郁悶。仔細記錄每日實驗過程無論是碩士還是博士，導師給我們上的堂課往往就是交代我們要詳細記好實驗記錄，只要是和實驗相關的。

轉錄組測序結果及TCGA數據庫分析）圖5RNA-Seq和m6A-seq聯合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類的RNA中，都已觀察到N6-腺苷(m6A)的甲基化，但其在microRNAs中還沒有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中，通過敲除m6A甲基轉移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說明miRNA受m6A甲基化的調控。進一步通過MeRIP-Seq發現相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過motif分析，他們發現了區分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀遺傳修飾在基因表達的轉錄調控的復雜性上增加了一個新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩定狀態的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">panstyle="color:#f5c81c;">xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">panstyle="color:#f5c81c;">(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。干貨分享 | PCR反應污染原因追蹤及污染處理方法。

用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選（細胞水平的結合和阻斷）、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器（以慢pMSCV載體為例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質粒、GAG質粒、VSV質粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構建1)根據目的基因mRNA編碼區設計引物，分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA，然后逆轉錄成cDNA，然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區序列，連接至pMD19-T載體后轉化至感受態DH5α，分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列，電泳割膠回收純化，連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉化到感受態DH5α，菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后，送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后，將質粒轉化至感受態DH5α中，并進行無內質粒抽提。GAG質粒和VSV質粒同樣可以轉化至感受態DH5α中，并進行無內質粒抽提。質粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養基培養6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。科研中我們涉及到的免疫沉淀實驗通常指：免疫共沉淀（Co-IP）、RIP、Chip等等，將幾種實驗簡單概述一下。寧夏疾病科研技術服務實驗

干貨分享 | TUNEL法檢測細胞凋亡原理和經驗.上海實驗科研技術服務培養

采用opti-MEM和Lipo3000分別轉染含有目的基因的pMSCV-eGFP、VSV、GAG質粒及對照載體，每皿加入脂質體-質粒轉染混懸液按購買脂質體相關說明書操作定量。繼續培養24h。2)24小時后，將培養基更換為新鮮的DMEM完全培養基，放進細胞培養箱繼續培養48~72h。3)48~72h后收集上層培養液，并過μm濾膜，采用ELISA法對所獲得的慢載體進行滴度測定。如不及時使用可以凍存于-80℃。3、慢轉染1)轉染前1天將細胞接種6孔培養板，時細胞的融合率約為50%，前需換液，加入1mLDMEM完全培養基。2)冰浴融化后加入相應體積的液及聚凝胺（Polybrene），混勻后放入37℃孵箱中繼續培養3)4h后補充1mL培養基，14h后換液（24h內換液即可）。4)72h后用倒置顯微鏡觀察熒光，監測效率，出現較多熒光時將等量的轉染細胞和未轉染細胞分別加入等濃度Puromycin（Puromycin或其他篩選濃度需要事先摸索）。5)待未轉染細胞全部死亡并且可觀察到滿意熒光量時，降低Puromycin濃度培養。也可以挑去單克隆細胞株進行進一步培養，以得到滿意的穩定表達目的基因的細胞株。6)使用qRT-PCR和Westernblot的方法檢測目的基因的表達量和蛋白水平是否顯著提高。7)由此可得三組細胞株：a.正常細胞株；b.空載載體的細胞株。上海實驗科研技術服務培養