這兩種層析都基于蛋白質的疏水性質，但應用條件和劇烈程度不同。HIC在生理條件或高鹽濃度下進行，高鹽濃度增強了蛋白質表面的疏水相互作用，使其與固定相上溫和的疏水基團（如苯基、丁基）結合。隨后通過降低鹽濃度的梯度進行洗脫。HIC非常適用于在離子交換后緊接著進行，因為前一步的高鹽樣品可以直接上樣。它能有效地分離由于構象差異或疏水貼片不同而表現各異的蛋白質。相比之下，反相層析（RPC）的固定相是密度極高的疏水基團（如C4, C8, C18），流動相是水與有機溶劑（如乙腈、甲醇）的混合物。蛋白質在RPC中經歷劇烈的變性條件，通過增加有機溶劑的比例被洗脫。RPC分辨率極高，主要用于肽段分析和質譜前處理，或對有機溶劑穩定的蛋白質的然后精純，但可能導致活性蛋白的變性。選擇合適的分離介質是蛋白純化成功的關鍵。寧夏親和層析

等電點沉淀是一種基于蛋白質在pH等于其等電點時凈電荷為零、溶解度比較低的原理進行的粗分離方法。通過調節樣品溶液的pH，可以使一類等電點相近的蛋白質或雜質沉淀出來，從而實現初步的富集或去除。該方法簡單、經濟，常作為大規模純化中的初始步驟。共價層析是一種特殊的親和層析，其固定相上的基團能與蛋白質表面的特定官能團形成可逆的共價鍵。例如，巰基丙基瓊脂糖凝膠可通過二硫鍵交換反應，特異性結合含有游離半胱氨酸殘基的蛋白質，隨后用含巰基還原劑（如L-半胱氨酸）的緩沖液進行洗脫。該方法可用于純化特定的酶或抗體片段。四川離子交換層析蛋白分離純化是新藥研發過程中不可或缺的一環。

在大腸桿菌等系統中表達重組蛋白時，一個常見的問題是目標蛋白可能以不溶性的、無活性的聚集體的形式表達，稱為“包涵體”。雖然這帶來了挑戰，但包涵體通常很純凈，且能抵抗蛋白酶降解。純化包涵體蛋白的策略與可溶性蛋白截然不同。首先需要通過超聲破碎細胞，然后通過離心收集包涵體沉淀，并用溫和的去垢劑（如Triton X-100）洗滌以去除附著雜質。關鍵的一步是“變性與復性”：使用高濃度的變性劑（如6-8 M鹽酸胍或尿素）溶解包涵體，使蛋白質去折疊為線性狀態。然后，通過緩慢地去除變性劑（如透析或稀釋），使蛋白質重新折疊恢復其天然構象和活性。復性過程復雜且效率低下，是包涵體蛋白純化的主要瓶頸。

層析技術是現代蛋白質純化的支柱，其主要原理是利用蛋白質在固定相（層析介質）和流動相（緩沖液）之間分配的差異，因理化性質不同而產生遷移速率差，從而實現分離。固定相被填充在層析柱中，當蛋白質混合物隨流動相流經時，與固定相相互作用力弱的蛋白質先被洗脫，而作用力強的則保留時間更長。根據相互作用的性質，衍生出離子交換、疏水、親和、凝膠過濾等多種層析模式，它們共同構成了一個多維度的純化工具箱。親和層析通常作為純化流程的第一步，旨在從粗提液中快速、特異性地“捕獲”目標蛋白。其原理是利用目標蛋白與固定相上配體之間高親和性的、可逆的生物特異性相互作用。較經典的例子是固定化金屬離子親和層析用于純化帶組氨酸標簽的重組蛋白，以及Protein A/G親和層析用于純化抗體。該方法能在一步之內實現數千倍的純化，極大地提高了純度，并有效濃縮了目標蛋白，是高效純化流程的基石。蛋白分離純化對于研究抗體藥物有著重要意義。

雖然電泳（如SDS-PAGE， 等電聚焦， 天然PAGE）主要用于分析，但它們也可用于小規模的制備或特殊用途的純化。制備型電泳可以在非變性條件下分離蛋白質，用于后續的活性研究或抗原制備。電洗脫是從凝膠切片中回收蛋白質的常用方法。更高級的系統，如制備型等電聚焦或連續流動電泳，可以處理更大體積的樣品。然而，電泳技術作為純化手段有其固有局限：通常處理量小，操作繁瑣，難以放大，且樣品中含有凝膠成分或緩沖鹽離子，需要額外的步驟（如透析）來去除。因此，在大多數情況下，電泳是強大的分析工具和層析的補充，而非主流制備方法。蛋白分離純化的目的是獲得高質量的功能性蛋白。漢南區親和層析

離子交換色譜可根據蛋白表面的電荷差異分離蛋白。寧夏親和層析

樣本預處理是蛋白分離純化的首要步驟，直接影響后續純化效果。對于固體生物樣本如動植物組織，需先通過機械破碎（勻漿、研磨）或酶解（胰蛋白酶、溶菌酶）方式破壞細胞壁與細胞膜，釋放胞內蛋白。液體樣本如發酵液則需進行離心或過濾處理，去除細胞碎片、沉淀等固體雜質。預處理階段還需加入蛋白酶抑制劑（如PMSF、EDTA）防止目標蛋白降解，加入抗氧化劑（如DTT、β-巰基乙醇）維持蛋白活性構象，同時控制pH值與溫度在適宜范圍，避免蛋白變性。寧夏親和層析

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