AAV病毒滴度通常分為物理滴度和infection滴度。物理滴度一般是指基因組滴度或者衣殼滴度。在測定AAV的含量時(shí)，通常采用基因組滴度或者衣殼滴度作為單位，其中基因組滴度為攜帶基因組的AAV的濃度，衣殼滴度為AAV物理顆粒的濃度。基因組滴度一般采用qPCR、ddPCR、染料法、UV/Vis等方法來測定；衣殼滴度主要是通過ELISA、HPLC等方法來測定。AAV基因組滴度檢測的關(guān)鍵在于盡可能徹底去除AAV衣殼外的HCD殘留，減少污染核酸對qPCR或ddPCR的影響。經(jīng)典方法是加入常規(guī)核酸酶（如Dnase I、Benzonase等）消化AAV衣殼外的HCD殘留，然后加入Proteinase K破碎病毒衣殼，進(jìn)行后續(xù)檢測。經(jīng)過對比發(fā)現(xiàn)，用SAN HQ高鹽核酸酶替代常規(guī)核酸酶處理AAV病毒，能夠更高效去除衣殼外的核酸殘留，qPCR或ddPCR結(jié)果重復(fù)性更高、更穩(wěn)定。SAN HQ高鹽核酸酶是一種新型的、耐高鹽的工程化內(nèi)切酶；陜西高鹽條件高鹽核酸酶70921-150

殘留的宿主DNA是生產(chǎn)中產(chǎn)生的雜質(zhì)，其存在潛在的致瘤性、傳染性和免疫原性等風(fēng)險(xiǎn)。相關(guān)研究表明，基因的大小普遍在200bp以上，因此大于200bp有可能會有一定的致病性，而且殘留DNA片段越大，生物制品的風(fēng)險(xiǎn)等級越高。因此，各國監(jiān)管機(jī)構(gòu)對其提出了嚴(yán)格要求。美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）在《關(guān)于人類基因zhiliao新產(chǎn)品生產(chǎn)指導(dǎo)文件》中明確指出HCD的片段要小于200bp。2022年5月，國家藥品監(jiān)督管理局藥品評審中心（CDE）發(fā)布的《體內(nèi)基因藥物產(chǎn)品藥學(xué)研究與評價(jià)技術(shù)指導(dǎo)原則（試行）》中也明確指出需對DNA殘留量和殘留片段大小進(jìn)行控制，建議盡量將DNA殘留片段的大小控制在200bp以下。福建上海倍篤生物高鹽核酸酶SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP級別高鹽核酸酶，于2023年Q4上市。

宿主細(xì)胞DNA（HCD）殘留以染色質(zhì)形式存在，其中有帶負(fù)電荷的DNA、帶正電荷及疏水區(qū)段的組蛋白，就像膠帶一樣能夠吸附很多物質(zhì)，包括各種雜蛋白、色譜填料、目的病毒顆粒。非特異吸附雜蛋白，會影響蛋白雜質(zhì)（如HCP）等的去除；吸附到色譜填料上，會降低色譜分離純化效率；吸附到目的病毒顆粒時(shí)，會影響目的產(chǎn)物的穩(wěn)定性，從而降低目的產(chǎn)物的得率。因此，從生產(chǎn)工藝層面來講，一定要去除HCD，從而能夠簡化工藝、提高目的產(chǎn)物的產(chǎn)量。

從國內(nèi)來看，由于 AAV 基因藥物研發(fā)管線絕大部分集中在眼科遺傳病上，載體用量較小，三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染 AAV 系統(tǒng)足以滿足未來的臨床及商業(yè)需求，因此，國內(nèi)的 AAV 生產(chǎn)系統(tǒng)主要以三質(zhì)粒為主。然而，考慮到未來 AAV 基因藥物在血液、神經(jīng)系統(tǒng)、肌肉系統(tǒng)等領(lǐng)域的臨床應(yīng)用，三質(zhì)粒系統(tǒng)顯然難以勝任。如藥明生基從國外收購了 OXGENE 的輔助腺病毒 AAV 生產(chǎn)系統(tǒng) TESSA，據(jù)報(bào)道較三質(zhì)粒系統(tǒng)有10倍的提升；而基因藥物 CDMO 企業(yè)北京五加和基因則在國內(nèi)率先采用了陳海峰博士的威洛克公司授權(quán)的Bac-to-AAV 系統(tǒng)，憑借公司在病毒載體領(lǐng)域持續(xù)30年的研發(fā)經(jīng)驗(yàn)，不斷摸索、試驗(yàn)，終于在臨床級生產(chǎn)方面獲得了巨大的成功，為 AAV 基因藥物管線研發(fā)公司錦籃基因進(jìn)行多批次臨床 CDMO 代工生產(chǎn)。在符合ISO13485:2016體系基礎(chǔ)上，增加了cGMP相應(yīng)要求。

氯化銫(CsCl)/碘克沙醇密度梯度離心大概是經(jīng)典的AAV純化技術(shù)了。這種技術(shù)適用于所有血清型且分辨率高，但是因生產(chǎn)工藝很難放大，低通量等缺點(diǎn)阻礙了其在工業(yè)中的應(yīng)用。繼密度梯度離心之后，色譜法不斷發(fā)展，并逐漸成為一種成熟的、主流的方法。色譜法通過載體的凈電荷、疏水性、對配體的親和性、大小以及其他性質(zhì)來分離并純化載體。這類技術(shù)有諸多的優(yōu)點(diǎn)：更具可擴(kuò)展性和成本效益，可多次重復(fù)使用，可并行運(yùn)行或串聯(lián)運(yùn)行，還可有效去除非定植劑，這是開發(fā)后期的一個(gè)關(guān)鍵方面。ArcticZymes于2005年在Olso證券交易所上市，精于規(guī)模化生產(chǎn)獨(dú)特特性的酶產(chǎn)品。安徽進(jìn)口生物試劑高鹽核酸酶70921-202

SAN HQ終產(chǎn)品經(jīng)過0.22 μm過濾除菌；陜西高鹽條件高鹽核酸酶70921-150

一般來說，生物生產(chǎn)工藝用的核酸酶以BenzonaseTM（BenzonaseTM是Merck的注冊商標(biāo)）為主，能高效降解任何形式（雙鏈、單鏈、線狀、環(huán)狀）的DNA和RNA。該酶來自于大自然界普遍存在的S.Marcescen，通過E.coli發(fā)酵生產(chǎn)得到。該酶的適宜反應(yīng)條件是低鹽濃度范圍（<100mM鹽濃度），且酶活隨著鹽濃度上升而下降，在300mM鹽濃度時(shí)酶活幾乎喪失。對于細(xì)胞基因藥物常用的兩種病毒載體LV和AAV，LV由于含有脂包膜結(jié)構(gòu)一般都在生理鹽條件下存在，而AAV在高鹽條件下不易團(tuán)聚、更穩(wěn)定。而在生理鹽濃度及更高濃度條件下，Benzonase活性受到抑制。陜西高鹽條件高鹽核酸酶70921-150