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胸水外泌體miRNA測序

來源: 發布時間:2023-03-26

免疫印跡或蛋白質印跡是分析外泌體較常用的方法之一,其原理是外泌體上特異性抗原與抗體結合。首先對樣品進行處理將囊泡裂解并將蛋白質變性,變性后,通過SDS-PAGE分離蛋白質,然后將其轉移到硝酸纖維素膜或聚偏二氟乙烯(PVDF)膜上并暴露于針對目的抗原的抗體中。抗體特異性識別膜表面上的抗原,然后將膜暴露于第二抗體中。通過二抗的熒光標簽或與二抗偶聯的辣根過氧化物酶或堿性磷酸酶基團進行檢測。常用的標記蛋白為CD63、CD81、TSG101和ALIX等。但是此方法的特異性和重復性會受到所用抗體質量的限制。外泌體的直徑比微泡的要小,后者直徑為100nm-1μm。外泌體的提取的方式:過濾離心。胸水外泌體miRNA測序

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全轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA,主要為mRNA和lncRNA、circRNA等非編碼RNA。外泌體中攜帶有來自母本細胞的多種蛋白質、脂類、短鏈RNA和長鏈RNA等重要信息。對外泌體中的長鏈RNA進行全轉錄組測序及分析,不只能夠篩選外泌體攜帶的特異Biomarker,同時對深入了解疾病或不同發育階段的內在機制也有重要意義。外泌體全轉錄組測序體系,充分結合了微量核酸建庫技術、NGS技術和全新的生物信息序列比對算法,可實現對1mL血漿中的外泌體即可進行mRNA、lncRNA和circRNA等RNAs充分測序,獲取周全的外泌體轉錄組信息。北京外泌體circRNA測序隨著外泌體研究的不斷深入,它的應用已經涉及醫學基礎和免疫領域、寄生蟲領域。

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流式細胞技術是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測的準確性也在不斷上升。將外泌體表面特異性標志物CD63、CD81等相應抗體進行標記,可用流式細胞儀檢測到陽性表達,從而實現對外泌體的定量。但流式細胞技術檢測時需要單顆粒懸浮液,當外泌體濃度高或分離過程中發生外泌體囊泡聚集時將導致一次觀察到多個顆粒,從而導致數據不準確。因此,為了通過流式細胞儀觀察,需要將外泌體通過免疫捕獲或共價結合固定在磁珠表面上,從而便于將外泌體囊泡暴露于已知或者預期在外泌體表面表達的抗原的熒光偶聯抗體中。在流式細胞術之前,可以在落射熒光顯微鏡(EPI)下觀察與磁珠和熒光抗體偶聯的外泌體囊泡。當樣品通過流式細胞儀時采集熒光信號,不只可以對外泌體進行高通量分析,還可以基于抗原表達對外泌體進行定量或分類。外泌體中常見的細胞質蛋白是Rabs蛋白,是鳥苷酸三磷酸酶家族的一種。

超速離心是外泌體提取較常用的方法也被認為是金標準,主要是根據外泌體的沉降系數、大小和形狀將其分離出來。首先4℃低速離心(300-500g,10min)去除死細胞以及細胞碎片,隨后以較高離心速度(2000xg,10min)去除生物聚合物以及凋亡小體,然后用10000xg,30min離心去除大型囊泡,結尾以超速離心沉淀外泌體。通過懸浮以及重復超速離心去除外泌體沉淀中的非外泌體蛋白。超速離心法具有操作簡單、不易被分離試劑污染、獲得的外泌體數量較多等優點。但是此方法需要昂貴的超高速離心機,每次處理的樣本量較小,費時,電鏡鑒定時還發現外泌體易聚集成塊,且上清中仍能檢測到大型囊泡,純度不高,另外高速離心會損傷外泌體影響下游實驗。外泌體通過內體途徑分泌到細胞外空間,并將各種生物活性分子(貨物)轉運至靶細胞。外泌體的提取的方式:密度梯度離心法。

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ELISA與WB的原理一樣,在抗體包被的微孔板中加入待測樣品、封閉、一抗孵育,洗滌后加入酶標待測物形成抗體-抗原-酶標抗體復合物,徹底洗滌后加顯色劑并用酶標儀測定吸光值,結尾用標準曲線計算外泌體表達量。ELISA能實現對外泌體特異性蛋白的定量。其他外泌體鑒定方法還有微流體測定法和外泌體蛋白質組學分析等。由于外泌體在各種生命過程中的重要作用及其作為疾病生物標志物和藥物輸送系統的潛力,人們對此領域的興趣越來越高。盡管目前在技術上取得了長足的進步,但尚未建立對外泌體進行準確和標準化鑒定以及定量的方法,關于外泌體的量應由囊泡顆粒的數量、囊泡蛋白的量或囊泡數與蛋白之比來定義仍存在比較多爭論。建立外泌體分離、表征以及效價測定的標準化方法將是外泌體作為診斷和診療用途之前需要解決的問題。外泌體實際應用之前,需要使用大型動物模型進行進一步研究和臨床試驗。外周血提取試劑盒價錢

1983年,外泌體初次于綿羊網織紅細胞中被發現。胸水外泌體miRNA測序

當外泌體在1980年初次被發現后,其被認為是細胞排泄廢物的一種方式,如今隨著大量對其生物來源、其物質構成及運輸、細胞間信號的傳導以及在體液中的分布的研究發現外泌體具有多種多樣的功能。外泌體的功能取決于其所來源的細胞類型,其可參與到機體免疫應答、抗原提呈、細胞遷移、細胞分化、肉瘤侵襲等方方面面。有研究表明肉瘤來源的外泌體參與到肉瘤細胞與基底細胞的遺傳信息的交換,從而導致大量新生血管的生成,促進了肉瘤的生長與侵襲。胸水外泌體miRNA測序

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