RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個(gè)復(fù)合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細(xì)胞、Hela細(xì)胞和HepG2細(xì)胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細(xì)胞核內(nèi)亞細(xì)胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基。上海研錄生物醫(yī)藥為您提供一站式科研技術(shù)服務(wù)。江蘇疾病模型科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)

注意事項(xiàng)1.病毒包裝的幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)主要包括:細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時(shí)的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)Σ《景b影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會(huì)影響到是否能包裝成功)。,需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮:病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話,也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基,但是可能效果會(huì)不太好。并且一般收病毒時(shí),培養(yǎng)基的營養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多,那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會(huì)損害細(xì)胞,所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時(shí)293T細(xì)胞狀態(tài)不好,或者鋪得過密,可以選擇放棄該次實(shí)驗(yàn)。2.目的載體過大,不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。江蘇疾病模型科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)細(xì)胞增殖與細(xì)胞凋亡、細(xì)胞周期等是研究的重要表型,是分子生物學(xué)和藥理學(xué)研究解決的問題之一。

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長(zhǎng)。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。
保存于嚴(yán)密緊塞或加蓋的容器里,同時(shí)在容器外上標(biāo)簽,并隨同材料在溶液中投入相應(yīng)的標(biāo)簽,以免相互混淆。標(biāo)簽上注明固定液、材料來源、日期等。標(biāo)簽上的文字,應(yīng)用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書寫。3.脫水注意事項(xiàng)(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當(dāng)組織中全部被二甲苯占有時(shí),光線可以透過,組織呈現(xiàn)出不同程度的透明狀態(tài)。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進(jìn)行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級(jí)的脫水劑時(shí),不要移動(dòng)材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內(nèi)剩余液,然后于皿中加入高一級(jí)脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級(jí)停留不宜太長(zhǎng),否則易使組織變軟,助長(zhǎng)材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級(jí)停留的時(shí)間也不宜太長(zhǎng),否則會(huì)使組織變脆,影響切片。(6)如需過夜,應(yīng)停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內(nèi)出現(xiàn)白色混濁現(xiàn)象。4.透明注意事項(xiàng)(1)使用透明劑時(shí),要隨時(shí)蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進(jìn)入。(2)更換每級(jí)透明劑,動(dòng)作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過程中,如果材料周圍出現(xiàn)白色霧狀,說明材料中的水未被脫凈。科研技術(shù)服務(wù)不僅提升了科研項(xiàng)目的成功率,也促進(jìn)了科研人才的培養(yǎng)與發(fā)展。

外泌體的功能外泌體可能作為細(xì)胞之間物質(zhì)和信號(hào)通訊的途徑,不同的細(xì)胞通過分泌攜帶不同組分的外泌體實(shí)現(xiàn)細(xì)胞間通訊,這些外泌體被受體細(xì)胞吸收,通過物質(zhì)交換或釋放內(nèi)含物實(shí)現(xiàn)物質(zhì)和信號(hào)的交流。外泌體與受體細(xì)胞的信息交流可能通過以下4種途徑實(shí)現(xiàn):外泌體表面膜蛋白質(zhì)被目的細(xì)胞表面的受體識(shí)別,從而靶細(xì)胞;外泌體在蛋白酶作用下產(chǎn)生的表面膜蛋白質(zhì)碎片可作為目的細(xì)胞表面受體的配體;外泌體脂膜可以與目的細(xì)胞膜融合,將蛋白質(zhì)和RNA等內(nèi)容物釋放進(jìn)去,此類膜融合可能改變靶細(xì)胞的一些膜特性,例如脂質(zhì)和膜蛋白質(zhì)的密度及種類;目的細(xì)胞通過胞吞的形式攝入外泌體經(jīng)由以上幾種途徑,外泌體將其攜帶的生物信息運(yùn)輸?shù)街苓叞屑?xì)胞或經(jīng)血液等體液運(yùn)輸而被遠(yuǎn)處組織細(xì)胞攝取,進(jìn)而影響目的細(xì)胞的基本功能和基因表達(dá)。幾乎所有的細(xì)胞都可以在自發(fā)或在一定刺激條件下產(chǎn)生外泌體,不同的細(xì)胞產(chǎn)生的外泌體具有不同的功能,這些外泌體參與了一系列生理和病理過程,如發(fā)生與發(fā)展、抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)、組織愈合等。此外,外泌體與疾病的研究表明:外泌體可能在代謝性疾病的出現(xiàn)以及心血管健康中發(fā)揮作用。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)這些取樣細(xì)節(jié),你有注意嗎?江蘇疾病模型科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
動(dòng)物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學(xué)科方法。江蘇疾病模型科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)
膿毒癥動(dòng)物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動(dòng)力學(xué)表現(xiàn)和高代謝狀態(tài);伴發(fā)多個(gè)功能障礙;有較高的自然死亡率,根據(jù)膿毒癥的轉(zhuǎn)歸,要求動(dòng)物模型的自然死亡率達(dá)到50%~70%;膿毒癥是嚴(yán)重引起機(jī)體的炎癥反應(yīng)過度造成的自身損傷,不是細(xì)菌和內(nèi)對(duì)機(jī)體的直接損傷,故出現(xiàn)功能障礙及動(dòng)物死亡距膿毒癥模型制備應(yīng)有一定的時(shí)間間距。一般在制模后6~12h后發(fā)生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應(yīng)所致。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的選擇在制作動(dòng)物模型時(shí)多選用雄性小鼠,因?yàn)榇菩孕∈筝^雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進(jìn)入發(fā)期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時(shí)更易于發(fā)生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結(jié)扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類膿毒癥機(jī)制的模型,被稱為膿毒癥模型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。CLP技術(shù)在20世紀(jì)70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個(gè)階段:盲腸遠(yuǎn)端結(jié)扎和盲腸穿刺。首先是手術(shù)引發(fā)的結(jié)扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應(yīng),其次是穿孔后使糞便內(nèi)容物漏入腹膜引起多菌性細(xì)菌性腹膜炎,進(jìn)而誘發(fā)全身性炎癥反應(yīng)。江蘇疾病模型科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)