m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。動物造模 | 膿毒癥造模方法之CLP造模法。黑龍江模式科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。貴州模式科研技術(shù)服務(wù)技術(shù)科研技術(shù)服務(wù)致力于推動前沿科技的研究與發(fā)展,為企業(yè)提供定制化的技術(shù)解決方案。

外泌體生物發(fā)生和神經(jīng)元細胞中分泌小泡的調(diào)節(jié)之間的交集為外泌體和神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機制之間假定的聯(lián)提供了新的見解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比,外泌體中的研究進展迅速,而且外泌體與的幾個主要特征有關(guān)。外泌體影響、生長和轉(zhuǎn)移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進展中的作用可能是動態(tài)的,并且與的類型、遺傳學(xué)和分期有關(guān)。外泌體的應(yīng)用外泌體用于免疫基于免疫細胞來源的外泌體能夠介導(dǎo)和調(diào)節(jié)機體對的免疫反應(yīng),外泌體在免疫方面的潛力受到關(guān)注。其中樹枝狀細胞產(chǎn)生的外泌體包含大量的MHC-多肽復(fù)合物和免疫刺激相關(guān)的分子,能夠相關(guān)的T細胞,介導(dǎo)體內(nèi)抗應(yīng)答,在多個臨床試驗中表現(xiàn)出良好的抗療效。有研究者考察了樹枝狀細胞外泌體對非小細胞肺患者的療效。結(jié)果表明,患者對樹枝狀細胞外泌體耐受性良好,1/3患者表現(xiàn)出了對樹枝狀細胞外泌體的T細胞響應(yīng),2/4患者自然殺傷細胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹突狀細胞外泌體免疫轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的臨床一期試驗結(jié)果,發(fā)現(xiàn)自體樹突狀細胞外泌體無明顯毒性,并且具有刺激自然殺傷細胞的能力。以上臨床試驗證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性,為進一步臨床研究奠定了基礎(chǔ)。
中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲、西安海棠學(xué)院院長馮居秦、西安交通大學(xué)人文學(xué)院EDP中心主任、中華風(fēng)采人物媒體社長王天保、西安市EMBA助企商會會長張西安、陜西省糖尿病協(xié)會副會長張麗、陜西省養(yǎng)生協(xié)會會長李靖、陜西省職業(yè)經(jīng)理人協(xié)會名譽會長劉志超、西藏鷹山科技集團董事長張沛、西安天歌干細胞健康管理中心總經(jīng)理楊海軍和團隊及各行各業(yè)企業(yè)界朋友、受益者近200人參與了活動。西安天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理楊海軍介紹了成立一年來的工作情況和未來的發(fā)展布局。隨后,天歌干細胞健康管理中心負責(zé)人分別同中華文化促進會文化創(chuàng)新與傳播委員會會長朱建聲;西安市(EMBA助企商會)/西安市EMBA商會會長張西安;鄭州天歌干細胞健康管理有限公司總經(jīng)理張永紅和上海豪景醫(yī)療器械有限公司總經(jīng)理張建國進行了簽約儀式。主持人同中華風(fēng)采人物媒體社長、新時代風(fēng)采人物研究會會長、文化名人收藏大家王天保,中華風(fēng)采人物媒體主編李西紅,西藏鷹山科技集團董事長張沛分別從幾個話題闡述和討論了大健康產(chǎn)業(yè)的未來前景。為了答謝各界朋友的的支持與厚愛,活動舉行了現(xiàn)場抽獎環(huán)節(jié),將活動掀起了高潮。通過活動一方面讓大家和身邊的朋友更關(guān)注健康。此外,動物模型的倫理問題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進行相關(guān)研究。

RNA甲基化修飾(m6A)研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個復(fù)合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結(jié)合SAM的組件,其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內(nèi)亞細胞器-核小斑(Nuclearspeckle)上,顯示m6A修飾可能和RNA的剪切加工相關(guān)。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用,并共定位于核小斑,影響甲基化效率,參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體的新亞基。免疫系統(tǒng),人體的免疫系統(tǒng)由免疫細胞、免疫分子構(gòu)成。黑龍江模式科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
裸鼠皮下成瘤模型造模意義.黑龍江模式科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
準(zhǔn)備碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分鐘,然后轉(zhuǎn)移至轉(zhuǎn)膜液中平衡3分鐘后備用。2、轉(zhuǎn)膜組裝轉(zhuǎn)膜三明治夾,這一步很關(guān)鍵,重要的是膠和膜之間不能有氣泡且膜與膠要保證貼合緊密(否則會翻車),可以加多點轉(zhuǎn)膜液泡著。組裝好后加滿轉(zhuǎn)膜液,設(shè)置電源參數(shù),我習(xí)慣恒流轉(zhuǎn)膜,200-280毫安,1-2小時,根據(jù)分子量定,如50KD的分子用60分鐘就夠了。如果一個電源帶兩個轉(zhuǎn)膜大槽即四塊膠,我就會用恒壓70-110V。這個過程重要的是做好降溫。這里簡單說一下蛋白分子量與玻璃板厚度,分離膠的濃度,轉(zhuǎn)膜電源參數(shù)的選擇問題。如果是能用1毫米的玻璃板就不用,因為轉(zhuǎn)膜是在電場的作用下蛋白分子從膠上遷移到膜上,1毫米膠的蛋白遷移距離要比。選擇更薄的膠蛋白轉(zhuǎn)膜時間可以減少,從而減少發(fā)熱,以免膠變形,條帶也會更好看。然后是分離膠的濃度,如果是150—200KD的分子選10%以下的的分離膠,200—300KD的選8%的,300KD以上的選6%的,小于30KD的200mA30分鐘,30-100KD的按分子量的數(shù)值算,如70KD,250mA70分鐘;100-150KD的250mA100分鐘;150—300KD的分子轉(zhuǎn)膜條件用280毫安(以上均是對于,),120分鐘足矣,前提是膠的濃度相適應(yīng)。五、封閉孵一抗1、封閉轉(zhuǎn)膜結(jié)束后。黑龍江模式科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)