高通量篩選時每天要對數以千萬的樣品進行檢測，工作枯燥，步驟單一，操作人員容易疲勞、出錯。自動化操作系統由計算機及其操作軟件、自動化加樣設備、溫孵離心設備和堆棧4個部分組成。自動化操作系統代替人工操作顯然有諸多優勢，它利用計算機通過操作軟件控制整個實驗過程，編程過程簡潔明了。微量篩選系統 由于高通量篩選采用的是細胞、分子水平的篩選模型．樣品用量一般在微克級（μg），節省了樣品資源，奠定了“一藥多篩”的物質基礎，同時節省了實驗材料，降低了單藥篩選成本。高通量篩選藥物分析儀。甘肅霉菌高通量篩選

化合物庫的質量包括三個方面：多樣性、有效濃度、化合物庫大小?；衔飵斓亩鄻有灾萍s著苗頭化合物的新穎性，而化合物的有效濃度則影響著活性化合物的檢出概率。因此化合物庫的多樣性越大，化合物的有效濃度越高意味著苗頭化合物檢出率更有保證。但是兩者之前需要有一個平衡，一個化合物庫里單一化合物簇（Cluster）維持在4~12個化合物的時候，多樣性和有效濃度都能得到保障。另外，對于化合物庫大小而言，理論情況下（基于多樣性、有效濃度以及靶點的成藥難度基本一致的隨機篩選而言），大的化合物庫有利于發現更多的苗頭化合物。但是基于此次有限的匯總數據來看（有4個化合物庫達到了百萬級（0.6M~1.8M）），定向化合物庫（FocusLibrary）（圖七中紅色圈部分）由于其自身的特點檢出率較好，而大的化合物庫并沒有帶來更高的苗頭化合物檢出率以及更高質量的苗頭化合物重慶高通量篩選平臺高通量篩選的前提是什么。

高通量篩選是藥物研發的一個重要手段，然而研究中發現一些化合物在不同類型靶點篩選中均表現出陽性結果，這類化合物稱為“頻繁命中化合物”（Frequent hitters）。根據篩選結果的有效性，頻繁命中化合物可以大致分為兩類，一是能與許多不同類型靶點成鍵結合的混亂化合物（Promiscuous compound）；二是通過干擾實驗條件而在多個實驗中呈現出陽性結果的假陽性化合物（False positive）。雖然混亂化合物可能成為多藥理作用的研究起點，但考慮其低選擇性容易與其他蛋白發生反應從而導致潛在的毒副作用，因此這類化合物通常不作為新藥物研發的優先；而假陽性化合物產生機制較為復雜，根據現有的研究主要可以分為：膠體聚集化合物、自熒光化合物、熒光酶抑制劑和化學易反應化合物。

為了避免頻繁命中化合物對實驗干擾，許多實驗方法，例如采用qHTS、ADP-Glo等更先進高通量篩選方法，或者采用交互實驗驗證等用于增強篩選結果可行度。此外，隨著更多晶體結構發現分享和生物實驗數據庫整理，頻繁命中化合物的探索變得更加可行。為人熟知且使用的就是PAINS（Pan-assay interference compounds）篩選規則。這是Baell等人在2010年基于六個不同靶點高通量篩選實驗結果，并將其中頻繁出現（≥4次）的化合物和相關結構總結為包含480個子結構的篩選規則。但這類規則主要針對的是化學易反應化合物，且PAINS規則本身也有很大局限性，因此，頻繁命中化合物相關篩選預測工具的開發仍然是現今研究熱點。在2017年，一篇由九名美國化學學會雜志主編聯名發表的文章“The Ecstasy and Agony of Assay Interference Compounds”中強調了實驗干擾引起的假陽性化合物的危害，告誡研究人員對篩選得出的陽性結果真實性需要反復確認，對潛在的假陽性結果需要提高警惕。為了更深入的了解頻繁命中化合物和相關機制。高通量篩選的藥物特點。

正如之前提到，在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多，用于衡量酶活性多的當屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景，比如吸光度檢出法，在終點法測定（endpointassay）時，如果化合物庫的吸收低于~410nm，實驗的背景吸收會引入假陽性（false-positive）和假陰性（false-negative）結果。雖然假陽性結果可以通過動力學Assay或者驗證Assay來解決，但是由于微量定量板有位于340~410nm的強吸收，所以仍舊會導致Z因子降低，直接結果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言，自發熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結果。在某種程度上，選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題，比如使用更長波段的光源，對于熒光檢出來說，>500nm會是比較好的選擇。小分子垂釣等高通量篩選。甘肅霉菌高通量篩選

細胞水平高通量篩選。甘肅霉菌高通量篩選

基于細胞水平的篩選的關鍵特征之一是可以一次篩選多個靶標。基于細胞的篩選常用于以下情況下：1)所需的分子靶標未知，2)靶標無法在生化測定中充分重組，3)所需的表型只存在于細胞環境中，例如從一種細胞類型分化到另一種細胞類型。基于細胞的檢測貫穿于藥物發現的所有階段：靶標選擇和驗證、初步篩選、先導化合物識別、先導化合物優化以及安全和毒理學篩選。介紹一些細胞水平分析的方法：細胞活力、報告基因、第二信使和高內涵成像等。甘肅霉菌高通量篩選

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