許多功能性蛋白質(zhì)是以多亞基復(fù)合物的形式存在的。純化這類復(fù)合物的挑戰(zhàn)在于保持其組裝的完整性和穩(wěn)定性。策略通常包括：1）共表達(dá)所有亞基，以期在細(xì)胞內(nèi)正確組裝；2）使用親和標(biāo)簽標(biāo)記其中一個亞基，利用該標(biāo)簽純化整個復(fù)合物；3）在整個純化過程中使用溫和的、接近生理條件的緩沖液，以防止復(fù)合物解離；4）避免使用強變性劑或劇烈條件；5）使用天然PAGE、SEC或多角度光散射（SEC-MALS）來驗證純化后復(fù)合物的組成、化學(xué)計量比和完整性。目標(biāo)蛋白的分離純化直接影響后續(xù)功能研究。遼寧離子交換層析

離子交換層析是根據(jù)蛋白質(zhì)表面凈電荷的不同進行分離的強有力工具。固定相是帶有電荷的基團：陰離子交換劑帶正電（如DEAE, Q），結(jié)合帶負(fù)電的蛋白質(zhì)；陽離子交換劑帶負(fù)電（如CM, SP），結(jié)合帶正電的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)在偏離其等電點（pI）的pH條件下會帶上凈電荷。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)樣品上樣到低鹽濃度的緩沖液中時，帶相反電荷的蛋白質(zhì)會與樹脂結(jié)合，而帶相同電荷或電荷很弱的蛋白質(zhì)則直接流穿。然后，通過逐步或連續(xù)地增加流動相中的鹽濃度（通常使用NaCl梯度），鹽離子與蛋白質(zhì)競爭結(jié)合樹脂上的帶電位點，結(jié)合力較弱的蛋白質(zhì)先被洗脫，結(jié)合力強的后被洗脫。IEX分辨率高，載量大，是中間純化步驟的常用選擇。新洲區(qū)膜蛋白分離純化基礎(chǔ)概念蛋白分離純化可用于研究蛋白質(zhì)的相互作用機制。

準(zhǔn)確測定蛋白質(zhì)濃度是純化過程中定量分析的基礎(chǔ)。它用于計算回收率、比活性以及為后續(xù)實驗準(zhǔn)備準(zhǔn)確劑量的樣品。有多種方法可供選擇，各有優(yōu)缺點。Bradford法基于蛋白質(zhì)與考馬斯亮藍(lán)G-250染料的結(jié)合，快速、靈敏，但不同蛋白質(zhì)之間的差異較大。BCA法基于蛋白質(zhì)在堿性條件下將Cu2?還原為Cu?，并與 bicinchoninic acid 顯色，受蛋白質(zhì)組成影響較小，且對去垢劑的耐受性更好。紫外吸光度法利用蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸在280nm處的吸光特性，操作簡便且無損，但受蛋白質(zhì)中這些氨基酸含量的影響，且核酸等雜質(zhì)會產(chǎn)生嚴(yán)重干擾。Lowry法則較為古老和繁瑣。在實踐中，通常需要根據(jù)樣品純度、緩沖液成分和所需精度來選擇合適的方法。

膜蛋白嵌于脂質(zhì)雙分子層中，具有疏水表面，使其在水溶液中極易聚集和沉淀，純化難度遠(yuǎn)大于可溶性蛋白。關(guān)鍵技術(shù)在于使用溫和的去垢劑（如DDM、Triton X-100）將其從膜中“溶解”出來，并在整個純化過程中維持去垢劑膠束的存在，以模擬其天然脂環(huán)境，保持其結(jié)構(gòu)和功能。親和標(biāo)簽策略在此同樣適用，但緩沖液配方的優(yōu)化更為復(fù)雜和關(guān)鍵。療愈性單克隆抗體的生產(chǎn)已形成高度標(biāo)準(zhǔn)化的下游純化平臺。其關(guān)鍵是Protein A親和層析，它能從細(xì)胞培養(yǎng)上清中高特異性、高效率地捕獲抗體，實現(xiàn)較好的純化效果。隨后通常緊跟低pH孵育以滅活病毒，再經(jīng)過離子交換層析（流穿模式）和疏水相互作用層析進一步去除宿主細(xì)胞蛋白、DNA、聚集體和殘留的Protein A。整個流程穩(wěn)健、高效，確保了藥品的安全性與有效性。蛋白分離純化過程中，樣品損失問題需特別關(guān)注。

無論是在學(xué)術(shù)研究還是工業(yè)生產(chǎn)中，成本都是一個重要因素。純化過程的成本包括：層析樹脂（介質(zhì)）的購買和壽命（可重復(fù)使用次數(shù)）、緩沖液和化學(xué)試劑的消耗、設(shè)備折舊與維護、以及人力成本和時間。工藝開發(fā)的目標(biāo)之一就是在保證產(chǎn)品質(zhì)量的前提下，優(yōu)化成本效益。這可能意味著：選擇載量高、壽命長的樹脂；減少純化步驟；開發(fā)重復(fù)使用多次的親和柱清洗驗證方案；將耗時的手工操作自動化；以及優(yōu)化緩沖液使用量以減少廢液處理成本。一個經(jīng)濟上不可行的純化工藝是無法實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的。穩(wěn)定的實驗設(shè)備是確保蛋白分離純化順利進行的必要條件。河南親和層析

凝膠過濾色譜利用分子大小差異純化蛋白質(zhì)樣品。遼寧離子交換層析

在離心之后，上清液可能仍含有細(xì)微的懸浮顆粒和脂質(zhì)，這些雜質(zhì)會堵塞后續(xù)的層析柱，明顯降低純化效率。深層過濾作為一種補充的澄清手段，利用由纖維素、硅藻土等組成的具有深度效應(yīng)的濾膜，通過機械截留和吸附作用捕獲這些微小顆粒。此步驟能有效保護下游層析系統(tǒng)，延長柱壽命，提高流程的穩(wěn)健性，特別是在大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)中，是不可或缺的預(yù)處理環(huán)節(jié)。經(jīng)過澄清的粗提液通常體積龐大且鹽分復(fù)雜，不適合直接進行精細(xì)純化。超濾濃縮是優(yōu)先的溫和濃縮方法，利用不同截留分子量的膜，在壓力驅(qū)動下使小分子溶劑和溶質(zhì)透過，而大分子蛋白質(zhì)被截留，從而實現(xiàn)快速濃縮和緩沖液交換。脫鹽或緩沖液交換則常使用凝膠過濾層析（如PD-10脫鹽柱）或超濾，旨在去除小分子雜質(zhì)（如鹽、去垢劑）或?qū)⒌鞍踪|(zhì)轉(zhuǎn)移至適合下一步純化的緩沖體系中，為后續(xù)層析步驟創(chuàng)造理想條件。遼寧離子交換層析

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